Aunque la biodiversidad existe en todas partes del mundo, ciertos lugares de la Tierra son particularmente ricos en especies. De acuerdo con las perspectivas existentes, “la mayoría de los biomas ricos en especies parecen ser los bosques tropicales húmedos, bosques tropicales caducifolios, arrecifes de coral, aguas profundas y los grandes lagos tropicales”. Algunos de los lugares con mayor diversidad biológica son también los más amenazados por la degradación del hábitat y la extinción de especies, por lo que se las califica como puntos calientes de biodiversidad o eco-regiones de crisis, por diversas organizaciones que evalúan las prioridades de conservación.

En áreas amenazadas de alta biodiversidad, como la Micronesia o la cuenca del Congo, existe un alto riesgo de que las especies endémicas (especies que son únicas en una ubicación específica) puedan extinguirse antes de que sean descritas o estudiadas por los seres humanos.

Para aprender más sobre las diferentes especies vea: Lista de animales y Lista de plantas.

La biodiversidad no descubierta también existe en hábitats que son, simplemente, difíciles de tener acceso para los seres humanos, tales como las profundidades del mar, toldos de selva tropical o el interior de otras plantas yanimales (que son característicos nichos ecológicos que albergan parásitos o microorganismos inofensivos). Los descubrimientos de animales vertebrados y plantas con flores han disminuido(aunque de ninguna manera detenidos) después de siglos de exploración, pero los taxones menos visibles se están descubriendo constantemente, desde insectos no descritos previamente a un mundo nuevo de animales invertebrados, el número de especies no descritas se estima es de millones. La cantidad de diversidad biológica descubierta en bacterias, arqueas y otros microbios, con la invención de la secuenciación del ADN es abrumadora, y su diversidad está comenzando a ser apreciada, planteando nuevos retos en nuestra forma de pensar acerca de la biodiversidad. Además, incluso entre las especies que se han nombrado, sólo una fracción ha sido estudiada en la naturaleza, más allá de su descripción inicial.